Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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