Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms