Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms