Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
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Rdh11Q9QYF1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Rdh11Q9QYF1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Rdh11Q9QYF1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
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Rdh11Q9QYF1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Rdh11Q9QYF1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Rdh11Q9QYF1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Rdh11Q9QYF1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Rdh11Q9QYF1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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