Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms