Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn2Q9ER65 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Clstn2Q9ER65 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms