Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ccdc17Q8CE13 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ccdc17Q8CE13 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ccdc17Q8CE13 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc17Q8CE13 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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