Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms