Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hcfc1Q61191 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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