Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms