Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc47Q505F5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms