Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms