Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc110Q3V125 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms