Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q149G0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q149G0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q149G0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q149G0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q149G0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q149G0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q149G0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Q149G0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q149G0 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q149G0 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q149G0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q149G0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q149G0 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Q149G0 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q149G0 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q149G0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q149G0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Q149G0 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms