Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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NfiaQ02780 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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NfiaQ02780 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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NfiaQ02780 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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NfiaQ02780 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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