Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Olfr169-203ENSMUST00000215476 2476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Pear1-216ENSMUST00000174759 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms