Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pitx2P97474 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms