Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
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Ccl21cP86793 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ccl21cP86793 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ccl21cP86793 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ccl21cP86793 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ccl21cP86793 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ccl21cP86793 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ccl21cP86793 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ccl21cP86793 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl21cP86793 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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