Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgd1P52734 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms