Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Pde6bP23440 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Pde6bP23440 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Pde6bP23440 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Pde6bP23440 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Pde6bP23440 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Pde6bP23440 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Pde6bP23440 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Pde6bP23440 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6bP23440 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Pde6bP23440 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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