Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RhoP15409 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RhoP15409 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RhoP15409 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RhoP15409 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RhoP15409 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RhoP15409 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RhoP15409 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RhoP15409 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RhoP15409 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RhoP15409 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
RhoP15409 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RhoP15409 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RhoP15409 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RhoP15409 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RhoP15409 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RhoP15409 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RhoP15409 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RhoP15409 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RhoP15409 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RhoP15409 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RhoP15409 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RhoP15409 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RhoP15409 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RhoP15409 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms