Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

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Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
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PtprqP0C5E4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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PtprqP0C5E4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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PtprqP0C5E4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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PtprqP0C5E4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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PtprqP0C5E4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
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PtprqP0C5E4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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PtprqP0C5E4 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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PtprqP0C5E4 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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PtprqP0C5E4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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PtprqP0C5E4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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PtprqP0C5E4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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PtprqP0C5E4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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PtprqP0C5E4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
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