Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms