Protein–RNA interactions for Protein: P01801

Ig heavy chain V-III region J606, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01801 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01801 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01801 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01801 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01801 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01801 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01801 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01801 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01801 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01801 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01801 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01801 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01801 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01801 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01801 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01801 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01801 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01801 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01801 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01801 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
P01801 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01801 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms