Protein–RNA interactions for Protein: O88892

Serf1, Small EDRK-rich factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serf1O88892 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Serf1O88892 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms