Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cited2O35740 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cited2O35740 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cited2O35740 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms