Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3278L7N2D2 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms