Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm2056J3QQ02 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms