Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms