Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Itgb4A2A863 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Itgb4A2A863 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Itgb4A2A863 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Itgb4A2A863 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Itgb4A2A863 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Itgb4A2A863 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Itgb4A2A863 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Itgb4A2A863 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Itgb4A2A863 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Itgb4A2A863 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Itgb4A2A863 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itgb4A2A863 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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