Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc83Q9D4V3 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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