Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Mrpl28Q9D1B9 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Mrpl28Q9D1B9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Mrpl28Q9D1B9 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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