Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rfc5Q9D0F6 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rfc5Q9D0F6 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rfc5Q9D0F6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rfc5Q9D0F6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rfc5Q9D0F6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rfc5Q9D0F6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rfc5Q9D0F6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rfc5Q9D0F6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rfc5Q9D0F6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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