Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Exo5Q9CXP9 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Exo5Q9CXP9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Exo5Q9CXP9 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Exo5Q9CXP9 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Exo5Q9CXP9 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Exo5Q9CXP9 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Exo5Q9CXP9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Exo5Q9CXP9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Exo5Q9CXP9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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Exo5Q9CXP9 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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Exo5Q9CXP9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Exo5Q9CXP9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Exo5Q9CXP9 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Exo5Q9CXP9 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Exo5Q9CXP9 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Exo5Q9CXP9 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Exo5Q9CXP9 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Exo5Q9CXP9 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Exo5Q9CXP9 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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