Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms