Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms