Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Rpl22-201ENSMUST00000103191 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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Trim35Q8C006 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Trim35Q8C006 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Trim35Q8C006 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Trim35Q8C006 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim35Q8C006 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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