Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rims3Q80U57 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 216.7 ms