Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Trim58Q5NCC9 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Trim58Q5NCC9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Trim58Q5NCC9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Trim58Q5NCC9 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Trim58Q5NCC9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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