Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Syne3Q4FZC9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Syne3Q4FZC9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Syne3Q4FZC9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Syne3Q4FZC9 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Syne3Q4FZC9 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Syne3Q4FZC9 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Syne3Q4FZC9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Syne3Q4FZC9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Syne3Q4FZC9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Syne3Q4FZC9 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Syne3Q4FZC9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Syne3Q4FZC9 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Syne3Q4FZC9 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Syne3Q4FZC9 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Syne3Q4FZC9 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Syne3Q4FZC9 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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