Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rnf180Q3U827 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rnf180Q3U827 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rnf180Q3U827 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rnf180Q3U827 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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