Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms