Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms