Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms