Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms