Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Irx2P81066 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms