Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp9xP70398 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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