Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Sh3bp1P55194 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Sh3bp1P55194 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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