Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD1P28340 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD1P28340 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms