Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms